En avalant son bol de céréales « Chocomiams », Stiveune, engloutit le sous-marin miniature offert avec le paquet. Une aubaine pour Pistou et Chimou, deux bactéries qui s’ennuyaient à mourir dans son estomac : en route pour l’aventure ! Commence alors, à bord de l’engin, une exploration palpitante du corps humain…